필리핀항공은 1941년 3월 아시아 최초로 상업운항을 시작해 취항 이래 현재까지 76년 동안 국제선 구간 무사고 경력으로 안전한 여행을 제공하고 있다. 한국 왕복 운항 스케줄은 인천-마닐라 노선에 매일 2회 오전 및 오후편 운항으로 풍부한 운항 편을 제공하고 있으며, 인천-세부 노선은 유일하게 매일 오전 편을 운항해 여행객들이 종일(Full time) 세부를 여행할 수 있도록 하고 있다. 인천-칼리보(보라카이) 노선은 매일 2편을 운항하고 있고 2017년 1월 1일부터 운항을 시작했다. 인천 클락은 주 4회 (수·목·토·일) 운항으로 오후편 리턴 스케줄로 보다 여유로운 스케줄을 자랑하고 있다. 부산-마닐라 노선은 매일 저녁 편으로 운항하고 있으며, 부산-칼리보는 주 4회 운항하고 있다.